女性不吸烟肺腺癌,为何第三次二代测序才发现ROS1基因融合?—抗癌管家-康爱管家互助群微信468826656

抗癌管家
2022-04-26

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她已经和肺癌搏斗了11年;他是曾经的肝癌患者...7年来,他们在群里为大家传授抗癌经验......“抗癌管家-康爱管家互助群”,是大家共同的抗癌家园。

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ROS1融合与多种肿瘤的发生发展紧密相关,在非小细胞肺癌(NSCLC)中突变频率约1%~2%。且ROS1融合多见于年轻、不吸烟或轻度吸烟的肺腺癌患者。对于EGFR和ALK阴性的患者来说,ROS1融合出现的比例更是高达5%。今天,在这里给大家分享一个年轻不吸烟肺腺癌的女性,为何第三次二代测序(NGS)才发现ROS1基因融合的案例。



患者信息

患者女,37岁,2020年1月18日,因咯血在当地市人民医院门诊就诊。诊断右下肺占位,纵隔淋巴结增大。后因咯血频率及量增大,2020年1月21日转诊至省人民医院确诊为右下肺腺癌。



治疗经过

2020年2月3日,为确保检查结果的准确性及进一步诊疗,患者来到广东省人民医院进行治疗,行锁骨上淋巴结穿刺活检及第一次基因检测后确诊为右下肺腺癌(cT3N3M0,ⅢC期,PD-L1 免疫组化90%)。

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图1:第一次基因检测结果

患者基线锁骨上淋巴结组织提示无NSCLC相关驱动基因突变

根据诊断结果给患者进行了“帕博利珠单抗200mg d1 q21d”单药免疫治疗。免疫治疗进行12周期后,复查胸部CT:右下肺团块影,大小约73*53mm,考虑PD (progressive disease疾病进展),患者PFS(progression-free survival无疾病进展生存期)为8个月。随后送锁骨上淋巴结和右肺组织进行第二次基因检测,二次基因检测仍未见EGFR、ALK、ROS1等驱动基因突变,免疫组化检测仍然提示PD-L1高表达,免疫组化85%。抗癌管家-康爱管家,我们一起抗癌,治愈癌症不是梦。康爱管家微信468826656。随后更换帕博利珠单抗+培美曲塞+铂类的治疗方案,用药期间有恶心、呕吐等不良反应,后续病情稳定并停止化疗。因病情控制不佳后换成帕博利珠单抗+安罗替尼治疗。

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图2:第二次基因检测结果

患者第一次进展后锁骨上淋巴结和右肺组织提示均无NSCLC相关驱动基因突变

复查患者治疗效果未有好转,行胸部CT时发现病灶增大,考虑病情进展,再次行NGS检测。第三次基因检测采用和瑞基因和全安大Panel进行检测,患者右肺组织送检发现ROS1-SDC4融合变异(变异丰度0.89%),PD-L1(98%)。得知检查结果后立即更换克唑替尼靶向治疗[1],目前已经口服克唑替尼26天,患者感觉所有不适症状消失,复查CT显示肺部病灶及淋巴结明显缩小,心包积液消失。

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图3:第三次基因检测结果

患者再次进展后右肺组织提示ROS1基因融合



案例总结

通过本案例,我们可以看出,想要发现ROS1融合,必须通过精准的基因检测技术来实现。融合检测本身较其他突变类型如点突变,检测难度更大。对于本案例来讲:

首先,对于ROS1这个基因要有足够的覆盖,就好比拿探测仪器对ROS1这个很长的基因的每个位置进行“仔细扫描”,外显子区域以及融合拼接点所在的内含子区域都要“扫描”到,这就是我们常说的“广度”。如果检测只覆盖一些热点,不是全长区域,检测就”扫描”不到某些位置,就很有可能会导致漏检。

第二,即使我们把ROS1常发生融合的位置都设置了“扫描”,但ROS1这个基因融合发生的位置比较特殊,它有很多重复的序列,导致扫描时也会存在不能仔细区分判断的情况,也可能会漏检,这时结合RNA检测则会更准确。

第三,以本案例来看,ROS1融合的比例相对较低,如果把患者的基因组比作“水池”,把突变基因比作“水池”里的“鱼”,把检测比作“鱼网”,不同突变是不同品种的鱼,且数量不一样,那么要想在“水池”里捞到量很少且特定品种的“鱼”,只有下网的“水池”足够大,即广度要够,且下足够的网,可以理解为深度要够,才能捞到足够多,足够罕见的“鱼”。也就是我们常说的“广度与深度”。

目前有很多结果表明,即便是罕见突变或低丰度突变依然可以使患者获益[2],和瑞基因的测序广度和深度一直以来都是测序行业里的佼佼者(组织测序深度:1000X,血液测序深度:15000X)。

肺癌基因检测不仅可以确定分子分型指导用药,在患者发生耐药后,基因检测也可以提示耐药的原因,有助于诊疗方案的进一步调整。无论是早期还是晚期患者,通过基因检测检查是否有基因重现,可进一步确定是否需要进行相关的干预。



治疗体会

1.   对于EGFR/ALK驱动基因阴性、肿瘤细胞PD-L1表达大于50%的晚期NSCLC,一线帕博利珠单抗的疗效显著优于含铂双药化疗,肿瘤客观有效率近5成,中位PFS10个多月[3],但本例只有8个月,低于中位值,疗效不算好,为什么呢?临床上应多思考。

2.   “女性,不吸烟,肺腺癌”这些优势人群,约70%~80%具有驱动基因,本例前两次常规的NGS基因检测没发现驱动基因,会不会是假阴性?换个检测技术平台或方法(比如RNAseq),或许也是一种诊断思路。

3.   即使是驱动基因阴性患者免疫治疗耐药后,对有条件的医疗机构和患者,也应鼓励重新活检(组织/液体),了解耐药分子机制,可能更有利于后续的个体化治疗。

4.   一个患者反复多次从外省奔波劳累来广州找同一个专科团队求医,本身就是对医者的极大尊重和信任,我们有什么理由不精益求精呢?

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关于和瑞基因

和瑞基因是全球肿瘤基因检测行业及癌症早筛赛道的代表性企业,秉持“一切肿瘤实现早诊早治,所有患者获得精准治疗”使命,致力于为高危人群及患者提供覆盖肿瘤全病程的分子检测产品,并携手药企等产业上下游探索创新治疗手段。抗癌管家-康爱管家,我们一起抗癌,治愈癌症不是梦。康爱管家微信468826656。和瑞基因已完成双 CAP认证(北京、福州)和三中心(实验、超算、研发)布局,产品涵盖肿瘤遗传易感检测、早期筛查、伴随诊断、疗效评估及预后监测,并已服务全国900余家医院、数十万名肿瘤患者及高危人群。在癌症早筛领域,和瑞基因依托自主研发的底层通用技术平台率先完成了肝癌早筛大规模前瞻性队列研究,并在肺癌及多癌种早筛方面取得突破性研究成果。




本文转自肿瘤资讯(由“抗癌管家网站-康爱管家”转载分享)





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